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质谱、SomaScan、Olink三强争霸!基于功能蛋白分析的血液蛋白质组学检测方法选择指南

在过去的一年中,血液蛋白质组学领域质谱法(MS)、SomaScan和Olink三大技术的成熟推动疾病研究进入“一滴血时代”,但耀眼数据背后,研究者正陷入前所未有的技术选择焦虑:三大主流技术平台成本差异悬殊,功能蛋白覆盖有什么差异?靶向与非靶向的技术路线,疾病研究应该选择谁?

凯发旗舰厅基于十余年技术积累,首次将最新人血浆蛋白质谱法(MS)自建库(QLHPP)与SomaScan、Olink靶向平台进行多维硬核对比,在功能蛋白检出、疾病领域覆盖等关键指标上揭示颠覆性结论,助您破解血液组学研究"选择困难症"。


技术介绍

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深度比较

凯发旗舰厅最新人血浆蛋白质组数据库(QLHPP)基于独家专利MagicOmics-DMB磁珠试剂盒进行低丰度蛋白富集前处理,基于质谱法(MS)使用timsTOF HT DIA 22 min检测构建,共收录11012个蛋白质,覆盖>90%人类蛋白质图谱(HPA)数据库收录的人血浆蛋白。

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QLHPP与HPA数据库收录人血浆蛋白venn图

HPA数据库收录的血浆蛋白均为拥有至少2个≥9个氨基酸的非嵌套唯一映射肽的典型蛋白,凯发旗舰厅拥有良好的可验证性。比较QLHPP、SomaScan、Olink蛋白与HPA数据库收录蛋白,发现QLHPP能够对HPA数据库实现最全面的覆盖(QLHPP 92%,Somascan 76%,Olink 46%),且拥有最丰富的独特鉴定蛋白(QLHPP 2923,Somascan 1984,Olink 715),代表其对验证与发现研究的全面兼容。

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QLHPP、Somascan、Olink与HPA数据库收录人血浆蛋白venn图

基于HPA数据库血浆蛋白丰度信息,比较QLHPP、SomaScan、Olink对不同丰度的蛋白质的覆盖度,发现QLHPP能够最全面地覆盖血液低、中、高丰度蛋白质,代表质谱法可对血液蛋白实现无偏深度检测。

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QLHPP、Somascan、Olink对HPA数据库各丰度人血浆蛋白的覆盖率

近期,在2024年实现7000+血浆蛋白质组鉴定数突破的基础上,2025年凯发旗舰厅血液蛋白质组高深度“峨眉”方案(MagicOmics DMB低丰度蛋白富集+timsTOF HT/Orbitrap Astral DIA质谱检测)人血浆样本项目可稳定鉴定5500~7500个蛋白质,为血液蛋白深度挖掘提供了良好的土壤。

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功能比较

COG(Clusters of Orthologous Groups)分析基于COG数据库提供蛋白质的功能分类注释。比较QLHPP、SomaScan、Olink蛋白的COG注释,发现QLHPP能够最全面地覆盖多数蛋白质功能类型。在疾病研究中,对不同信号或代谢通路的功能蛋白开展研究,能够反应更具生物学意义的疾病变化,为标志物、机制、药靶研究提供更有力的支持。

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此外,通过Uniprot数据库对血浆中鉴定到的蛋白质相关的生物学途径、疾病、分子功能等信息进行注释,发现QLHPP也能够最全面地覆盖多数常见通路、疾病与功能。

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血液蛋白与多种疾病发生发展相关,囊括诸多药物靶点蛋白。通过DrugBank、FDA、KEGG Drug、ChEMBL、Phenotypes数据库的注释信息,可以更好地了解血液蛋白与疾病的关系。比较QLHPP、SomaScan、Olink蛋白的疾病药靶数据库注释,发现QLHPP能够最全面地覆盖多个疾病药靶数据库。

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来源比较

血液不具备蛋白质合成功能,血液中的蛋白质由身体各组织器官分泌释放而来,因此组织器官溯源对血液蛋白质组研究具有重要意义,能够支持对不同部位起源疾病及并发症的精准解析。使用HPA数据库的人类正常组织器官数据对血液蛋白的组织器官来源进行注释,比较QLHPP、SomaScan、Olink蛋白,发现QLHPP能够最全面地覆盖多个组织器官来源。

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蛋白质亚细胞定位预测在生物学研究中具有重要意义。比较QLHPP、SomaScan、Olink蛋白,发现QLHPP能够最全面地覆盖细胞核、细胞质来源蛋白,表明质谱法能够深入覆盖来源于细胞内、细胞核的低丰度蛋白,探索信号通路变化,助力进一步的疾病机制与药物靶点研究。

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应用展望

随着检测技术的成熟,针对血浆蛋白的研究日渐深入,丰富的血浆蛋白质组数据可以获得有关疾病、衰老过程以及疾病风险预测的新见解。

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血浆蛋白质组检出量逐年提升

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血浆蛋白质组深度提升助力更多领域研究

 

深度保障

针对血浆蛋白质组低丰度蛋白检测难点,凯发旗舰厅提供独家专利产品低丰度蛋白富集磁珠试剂盒(MagicOmics DMB),结合自动化样本前处理机器人(MagicOmics-AP-96-Pro)与timsTOF HT/Orbitrap Astral先进质谱平台,可实现高通量血浆蛋白质组样本标准化制备与高深度检测,轻松承接大队列血浆标志物研究项目。

对于100例以上人血浆样本,按照推荐流程标准化采集、质检合格并执行高深度峨眉方案(MagicOmics DMB低丰度蛋白富集+timsTOF HT/Orbitrap Astral DIA质谱检测),凯发旗舰厅承诺蛋白鉴定数5000+!

步骤虽繁必不敢省人工,试剂虽贵必不敢减物力,凯发旗舰厅助您在科研的海洋中乘风破浪~

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