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CHARACTERISTIC

技术特点

  • 当蛋白构象发生变化时(例如与小分子结合),会暴露出不同的广谱性蛋白酶酶切位点。

  • 一次酶切后再将蛋白样品变性,用胰酶进行二次酶切。

  • 通过质谱检测,比较不同处理条件的样品中,全酶切及半酶切肽段(LiP酶切)的信号强度变化,可以分析蛋白构象变化。

  • 通过分析差异肽段的情况可以确定小分子与蛋白结合的区域。


Applications

应用方向

ADVANTAGES

服务优势

提供行业领先的生物信息分析内容

根据原始数据,提供结构差异蛋白和丰度差异蛋白两个维度的信息,同时提供结构和丰度联合分析的结果。每个模块提供差异蛋白筛选、蛋白功能富集和分析及相互作用分析,结构差异蛋白还提供结构变化蛋白的二维码图和3D结构图。


实验设计丰度变化结构变化联合分析二维码图3D图
有胰酶对照(TrP组)
无胰酶对照(TrP组)××


两种服务类型灵活选择

标准版服务(同时进行(PK酶+TrP酶)和(TrP酶)酶切)能够提供更全面的信息(丰度+结构),经济版(只进行(PK酶+TrP酶)酶切)适用于更关注蛋白结构的研究需求(结构)


服务类型


服务内容


标准版

1、每个样本2种酶切方法:1)蛋白酶K+TrP酶;2)TrP酶

2、每个样本2次质谱检测

3、结构肽段的丰度校正

4、差异丰度蛋白分析

5、差异结构蛋白分析

6、差异丰度和结构蛋白联合分析


经济版

1、每个样本1种酶切方法:蛋白酶K+TrP酶

2、每个样本1次质谱检测

3、差异结构蛋白分析


适配不同应用场景的解决方案

内容常规报告药物靶点报告
丰度信息
丰度数据
结构信息
结构数据

丰度分析

×

结构分析

联合分析

×

数据库注释

×
二维码图

差异肽段的酶切情况

×

3D图


  • 提供行业领先的生物信息分析内容

  • 两种服务类型灵活选择

  • 适配不同应用场景的解决方案

ANALYSIS PROCESS

分析流程

LiP-MS生信分析流程

RESULT DISPLAY

结果展示

LiP-MS生信分析结果

CLASSIC CASES

经典案例

LiP-MS发现帕金森病结构标志物

发表期刊:Nature structural & molecular biology
影响因子:12.5
发表单位:苏黎世联邦理工学院
发表时间:2024.07.29

查看详情
SAMPLE REQUIREMENTS

样本要求

样本类型送样量要求/样本运输
动物组织10 mg干冰运输
植物组织

 柔软组织

(木本植物的叶、花等,草本植物,藻类,蕨类植物)  

400 mg

坚硬组织

(根、树皮、树枝,果实种子等) 

4 g
细胞2*106
蛋白质溶液(非变性裂解液)1 μg/μL(不低于200 μL)
血清100 μL
脑脊液200 μL


FAQ

常见问题

  • TrP酶酶切的作用是什么?

    ?可以同时分析丰度,对结构信息进行补充 

    ?可以利用丰度信息对结构肽段进行校正,增加数据可信度


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